Д-р Емил Кръстев е началник на Клиниката по Неврохирургия в Университетска многопрофилна болница Софиямед. Специализирал е в Германия, Холандия, Австрия, Швейцария.
От 2000 до 2011 г. е бил завеждащ на отделението по съдова неврохирургия в Пирогов.

Д-р Кръстев има богат опит в успешното извършване на сложни мозъчни операции - тумори на централната и периферната нервна система, гръбначен стълб и гръбначен мозък, травматични увреждания на нервната система, заболявания на съдовете на мозъка - аневризми и други малформации, всички видове заболявания и травми на целия гръбначен стълб.

В клиниката под негово ръководство се извършва оперативно лечение с най-съвременните методики в гръбначната хирургия - безкръвни операции при дискови хернии. Операции чрез мозъчен байпас при тежка артериална недостатъчност на мозъка. Тук е единственото място в България, където се извършват мозъчни байпас процедури.